Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms