Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms