Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALKBH4Q9NXW9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALKBH4Q9NXW9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALKBH4Q9NXW9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALKBH4Q9NXW9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALKBH4Q9NXW9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms