Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms