Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms