Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms