Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms