Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms