Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF3Q9NRP4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms