Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG4Q9H9E3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms