Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms