Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR12Q9C0I1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms