Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms