Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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