Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms