Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms