Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms