Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms