Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms