Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD2Q9BTF0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms