Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms