Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms