Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms