Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms