Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.6 ms