Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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