Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms