Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms