Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms