Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms