Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms