Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms