Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms