Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG2BQ96BY7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG2BQ96BY7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms