Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms