Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms