Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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