Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX29Q8TEQ0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms