Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPAS3Q8IXF0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms