Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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