Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms