Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKD1L3Q7Z443 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L3Q7Z443 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms