Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms