Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms