Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP3Q76B58 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP3Q76B58 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms