Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAXIP1Q6ZW49 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms