Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms