Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms