Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms