Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms